2020_21
Guia docent 
Escola Tècnica Superior d'Enginyeria
A A A 
català 
Doble titulació de grau d'Enginyeria Informàtica i de Biotecnologia (2014)
 Assignatures
  BIOINFORMÀTICA
   Continguts
Tema Subtema
1) Introducció Definició i àmbit d’estudi
Portals de bioinformàtica (EBI-EMBL, NCBI, Expasy)
2) Bases de dades bioinformàtiques Bases de dades bibliogràfiques (PubMed, ISI Web of Knowledge), bases de dades de seqüències (UniProt, GenBank). Altres bases de dades.
3) Introducció al sistema operatiu LINUX i al llenguatge de programació Python Introducció al sistema operatiu LINUX. Instal.lació de paquets. Tasques senzilles per terminal. Introducció al llenguatge de programació Python.
4) Cerca i anàlisi de seqüències Concepte d’homologia. Alineaments de parells de seqüències (algoritmes de Needelman-Wunsch i Smith-Waterman). Dotplots. Matrius de substitució (PAM, Blosum). Cerca de seqüències semblants (BLAST).
5) Alineaments múltiples i construcció d’arbres filogenètics Programes d’alineament múltiple de seqüències (Clustal). Bases de dades derivades de multialineaments (PROSITE). Mètodes de reconstrucció filogenètica. Visualització d’arbres filogenètics.