2011_12
Guia docent 
Facultat d'Enologia
A A 
català 
 
 
Biotecnologia (2005)
 Assignatures
  MODELITZACIÓ DE MOLÈCULES I BIOMOLÈCULES
   Continguts
Tema Subtema
1. Introducció. Software de disseny molecular. Definicions. Evolució històrica. Aplicacions. Sistemes de coordenades. Superfícies d’energia potencial. Teoria de l’estat de transició. Propietats moleculars. Unitats de distància i energia.
Exercici pràctic: Construcció i disseny de diverses estructures moleculars bioquímiques, orgàniques, i inorgàniques. Recursos web.
2. Mètodes Clàssics. Aplicació a sistemes bioquímics. L’energia de la mecànica molecular. Simulacions de dinàmica molecular. Simulacions Monte Carlo. Mètodes QSAR. Anàlisi conformacional.
Exercici pràctic: Simulació dinàmica d’una proteïna.
3. Mètodes Híbrids de Mecànica Quàntica / Mecànica Molecular (QM/MM). Conceptes de Mecànica Quàntica. Mètodes de Mecànica Quàntica i Semiempírics. Classificació. Tractament de les connexions.
4. Mètodes QSAR (Quantitative Structure Selectivity Relationship). Definicions. Descriptors. QSAR tridimensional. CoMFA (Comparative Field Analysis). Programari.