2010_11
Guia docent 
Escola Tècnica Superior d'Enginyeria Química
A A A 
català 
Nanociència i Nanotecnologia (2010)
 Assignatures
  BIOINFORMÀTICA
   Continguts
Tema Subtema
1. Introducció. Què és la bioinformàtica?
Fonaments d'estructura d'àcids nucleics i de proteïnes.
Genomes i proteomes.
L'evolució a nivell molecular.
Matrius de distància.
Principals bases de dades d'àcids nucleics i proteïnes.
Mineria de dades en bases de dades de biologia molecular: l'SRS.
2. Comparació de seqüències. Mesures de la semblança entre dues seqüències.
Alineament de dues seqüències.
Multialineament.
Arbres filogenètics.
Aplicació de la comparació de seqüències a la mineria de dades.
3. Anàlisi comparativa de genomes. Anàlisi i anotacio de genomes.
Aplicació de la genòmica comparativa en la reconstrucció de vies metabòliques.
4. Relació estructura/funció en proteïnes. Fonaments de la determinació experimental de l'estructura proteica.
La base de dades del PDB: mineria de dades en ella i anàlisi de la informació continguda en ella.
Anàlisi de l'estructura proteica mitjançant software de visualització molecular.
Relació estructura/evolució i correlació amb estructura/funció.
Predicció de la funció.
Docking.
5. Obtenció d'informació estructural en proteïnes d'estructura desconeguda. Predicció de l'estructura secundària.
Predicció del plegament.
Modelat per homologia.
6. Enginyeria de proteïnes. Propietats de les proteïnes susceptibles de ser millorades.
Selecció de mutacions d'acord amb la propietat a millorar.
Mutagènesi "in silico".
7. Introducció a la programació en lleguatge PERL. Conceptes bàsics del PERL.
Disseny d'algoritmes bioinformàtics.