Guia docent Escola Tècnica Superior d'Enginyeria |
català |
Doble titulació de grau en Enginyeria Informàtica i en Biotecnologia (2014) |
Assignatures |
BIOINFORMÀTICA |
Continguts |
DADES IDENTIFICATIVES | 2023_24 |
Assignatura | BIOINFORMÀTICA | Codi | 17914104 | |||||
Ensenyament |
|
Cicle | 1r | |||||
Descriptors | Crèd. | Tipus | Curs | Període | ||||
6 | Obligatòria | Segon | 2Q |
Competències | Resultats d'aprenentage | Continguts |
Planificació | Metodologies | Atenció personalitzada |
Avaluació | Fonts d'informació | Recomanacions |
Tema | Subtema |
Introducció | Definició i àmbit d’estudi Portals de bioinformàtica (EBI-EMBL, NCBI, Expasy) |
1) Bases de dades bioinformàtiques | Bases de dades bibliogràfiques (PubMed, ISI Web of Knowledge), bases de dades de seqüències (UniProt, GenBank). Altres bases de dades. |
2) Introducció al sistema operatiu LINUX i al llenguatge de programació Python | Introducció al sistema operatiu LINUX. Introducció al llenguatge de programació Python. |
3) Cerca i anàlisi de seqüències | Concepte d’homologia. Alineaments de parells de seqüències (algoritmes de Needelman-Wunsch i Smith-Waterman). Dotplots. Matrius de substitució (PAM, Blosum). Cerca de seqüències semblants (BLAST). |
4) Alineaments múltiples i construcció d’arbres filogenètics | Programes d’alineament múltiple de seqüències (Clustal). Bases de dades derivades de multialineaments (PROSITE). Mètodes de reconstrucció filogenètica. Visualització d’arbres filogenètics. |