Guia docent 2011_12 Facultat de Medicina i Ciències de la Salut

Continguts

Tema	Subtema
1. Introducció. Software de disseny molecular.	Definicions. Evolució històrica. Aplicacions. Sistemes de coordenades. Superfícies d’energia potencial. Teoria de l’estat de transició. Propietats moleculars. Unitats de distància i energia. Exercici pràctic: Construcció i disseny de diverses estructures moleculars bioquímiques, orgàniques, i inorgàniques. Recursos web.
2. Mètodes Clàssics. Aplicació a sistemes bioquímics.	L’energia de la mecànica molecular. Simulacions de dinàmica molecular. Simulacions Monte Carlo. Mètodes QSAR. Anàlisi conformacional. Exercici pràctic: Simulació dinàmica d’una proteïna.
3. Mètodes Qualitatius. Aplicació a la reactivitat orgànica.	Introducció als orbitals moleculars. Diagrames de Walsh. Teoria d’orbitals moleculars frontera. Regles de Woodward-Hoffmann. Exercici pràctic: Reaccions de cicleaddició (Diels-Alder).
4. Mètodes de Estructura Electrònica. Aplicació a sistemes amb metalls de transició.	Mètodes ab initio. Funcions de base. Mètodes DFT. Exercici pràctic: Interacció metall-lligand en complexes de metalls de transició.