| Guia docent Facultat d'Enologia |
català |
| Grau en Biotecnologia (2009) |
 Assignatures |
| BIOINFORMÀTICA |
| Continguts |
| DADES IDENTIFICATIVES | 2021_22 |
| Assignatura | BIOINFORMÀTICA | Codi | 19204103 | |||||
| Ensenyament |
|
Cicle | 1r | |||||
| Descriptors | Crèd. | Tipus | Curs | Període | ||||
| 6 | Obligatòria | Segon | 2Q |
|||||
| Competències | Resultats d'aprenentage | Continguts |
| Planificació | Metodologies | Atenció personalitzada |
| Avaluació | Fonts d'informació | Recomanacions |
| Tema | Subtema |
| Introducció | Definició i àmbit d’estudi Portals de bioinformàtica (EBI-EMBL, NCBI, Expasy) |
| 1) Bases de dades bioinformàtiques | Bases de dades bibliogràfiques (PubMed, ISI Web of Knowledge), bases de dades de seqüències (UniProt, GenBank). Altres bases de dades. |
| 2) Introducció al sistema operatiu LINUX i al llenguatge de programació Python | Introducció al sistema operatiu LINUX. Instal.lació de paquets. Tasques senzilles per terminal. Introducció al llenguatge de programació Python. |
| 3) Cerca i anàlisi de seqüències | Concepte d’homologia. Alineaments de parells de seqüències (algoritmes de Needelman-Wunsch i Smith-Waterman). Dotplots. Matrius de substitució (PAM, Blosum). Cerca de seqüències semblants (BLAST). |
| 4) Alineaments múltiples i construcció d’arbres filogenètics | Programes d’alineament múltiple de seqüències (Clustal). Bases de dades derivades de multialineaments (PROSITE). Mètodes de reconstrucció filogenètica. Visualització d’arbres filogenètics. |
